Изглежда, че имате някои синтактични грешки във вашата SQL заявка, опитайте първо да проверите това.
Успях да импортирам 800mb база данни с помощта на командния ред.
Опитайте :
mysql -p -u username -h 127.0.0.1 database < database.sql
Кажете ми дали работи.