MySQL всъщност позволява актуализации на множество таблици в една заявка (въпреки че често има смисъл приложението ви да прави една по една).
UPDATE table_1, table_2
SET table_1.field = <some value>, table_2.field = <some value>
WHERE table_1.field2 = table_2.field_2
AND table_1.field_3 = <some other value>
Вижте:http://dev.mysql.com/doc/refman /5.1/bg/update.html
Както са заявили други хора, трябва да разгледате използването на подготвени изявления.