MySQL променливата `max_allowed_packet` автоматично се нулира до 1MB

А, трябва да отмените "супер" привилегиите. Той дава разрешение за използване на SET GLOBAL .

REVOKE SUPER ON *.* FROM 'username'@'localhost';
FLUSH PRIVILEGES;

http://dev.mysql.com/doc /refman/5.7/en/privileges-provided.html#priv_super