Лично мнение:Не трябва да използвате MyISAM за нищо ново. InnoDB поддържа множество функции, които MyISAM не поддържа, като най-важните са транзакциите, последвани от референтна цялост и куп други елементи.
Много хора ще се опитат да твърдят, че MyISAM е по-бърз и затова все още има място, но а) тази празнина се е затворила значително и ускоренията могат да се правят извън базата данни (т.е. memcached и т.н.), и б) бърза база данни с лоши данни не е толкова полезно.
