Това е така, защото индексът, който сте създали, също заема място. В случай на клъстериран индекс в InnoDB, данните от реда всъщност се съхраняват вътре в крайните възли на индекса, така че когато се използва индексът, индексът не сочи към реда, а вместо това сочи към възела на индекса, който съдържа данните за реда покрай с PKEY.
Това доведе до много по-голямо място за съхранение.