Mysql изтрива всички публикации, които имат даден meta_key

можете да изтриете с select, като използвате оператор IN() и да поставите select в IN така

DELETE FROM `wp_postmeta` 
WHERE `post_id` IN 
(   SELECT `post_id`
    FROM `wp_postmeta`
    WHERE `meta_key` LIKE 'acest_meta' 
)