Попадал съм на подобна ситуация. Изглежда, че минималният и максималният размер на пула не работят, когато се използват екземпляри на ec2 с балансирано натоварване, работещи с .net ядро. В моя случай удря aurora mysql.
Проблемът изглежда е свързан с наличието на различни низове за връзка с различни минимални и максимални настройки на различни екземпляри на ec2. Изглежда, че обърква мин. и макс.
Работата за заобикаляне (или може би поправка) е да се уверите, че настройките за минимален и максимален пул са еднакви за всички ec2 екземпляри. които удрят db клъстера.