Успях да изхвърля вградената схема. Получих го от страница със съвети на Amarok
libmysqld.dll ви позволява да използвате mysql във вашата програма, без да настройвате сървър или да зареждате deamon. Също така създава същите файлове като сървъра (директория mysql, директория на схемата и файл ibdata1). Така че поставих тези файлове в директория и казах на mysqld linux deamon да използва тази директория като datadir:
mysqld_safe --user=mysql --datadir=/data/myEmbededDB --skip-grant-tables
--skip-grant-tables ще позволи да се свържете с всеки потребител или парола
Тъй като сървърът сочи към тази директория, сега мога да изхвърлям вградената схема с mysqldump точно както всяка друга схема на mysql. Същото важи, ако искате да използвате WorkBench със схема, създадена с libmysqld.dll
Надяваме се това да помогне на други объркани потребители на libmysqld.dll
:-)