Звучи ми като задача за LEFT OUTER JOIN, така:
SELECT parent.name, COUNT(product.item_id),
(select count(*) from Category parent2
where parent.lft > parent2.lft
and parent.rgt < parent2.rgt) as depth
FROM Category parent
LEFT OUTER JOIN Category node
ON node.lft BETWEEN parent.lft AND parent.rgt
LEFT OUTER JOIN Item_Category product
ON node.category_id = product.category_id
GROUP BY parent.name
ORDER by node.lft
По този начин гарантирате, че всички категории са показани. Имайте предвид, че не съм 100% сигурен.
РЕДАКТИРАНЕ:Добавен подизбор за дълбочина, опитайте.
РЕДАКТИРАНЕ:Премахната запетая