Инструмент, който преобразува mySQL заявка в Zend FrameWork заявка

Нямате нужда от инструмент за това. В компонента Zend_Db на Zend Framework можете да правите:

$stmt = $db->query($sql);

Ако $sql е избран, тогава можете да извлечете данните с:

$rows = $stmt->fetchAll();

Като алтернатива, ZF е просто PHP рамка, така че нищо не ви пречи да продължите да използвате PDO или mysqli директно.