Можете да използвате DATE_FORMAT функция във вашите избрани.
За датата:
'%Y-%m-%d'
За време:
'%H:%i:%s'
Така че нещо като:
UPDATE `table`
SET `datetimecol` = CONCAT_WS(' ', DATE_FORMAT(`datecol`, '%Y-%m-%d'), DATE_FORMAT(`timecol`, '%H:%i:%s'))