В крайна сметка намерих решение:добавяне на --skip-tz-utc опция към скрипта за експортиране.
Това просто гарантира, че точната дата, която експортирате, е импортираната във втората база данни. Работи ми, тъй като базите данни са в една и съща часова зона, но може да не е идеална за други, чиито бази данни са в различни часови зони.
