Ще трябва да го компилирате на ръка, вместо чрез PECL. Ще трябва да знаете къде е вашата инсталация на MySQL. Не знам за пакетите Entropy, но компилациите, предоставени от MySQL (които препоръчвам), се инсталират в /usr/local/mysql .
$ pecl download pdo_mysql
$ tar xzf PDO_MYSQL-1.0.2.tgz
$ cd PDO_MYSQL-1.0.2
$ phpize
$ ./configure --with-pdo-mysql=/usr/local/mysql
$ make && sudo make install
И това трябва да ви доведе до точката, в която можете да го конфигурирате.
