Трябва да правите разлика между 2 колони с едно и също име, като използвате псевдоним за една или и двете от 2-те колони в заявката по този начин
SELECT a.`date`, b.`date` as b_date
FROM table1 a
JOIN table2 b ON a.id = b.a_id
WHERE some specific criteria
Сега, когато извлечете ROW всяка date
има свое уникално име, т.е.
$row->date;
$row->b_date;