ALTER TABLE ..
може да се използва за преместване на таблици от една база данни в друга:
alter table my_old_db.mytable rename my_new_db.mytable
Предупреждение:както поискахте, това е ход, а не копие към новата база данни!
Но вие ще запазите данните от таблицата (а не ограниченията за целостта, ако се прилагат във вашия случай)
По отношение на php, php може да изпълнява sql команди, така че няма да е проблем.