Как да видя разликите между 2 дъмпа на MySQL?

стартирайте mysqldump с "--skip-opt", за да получите 2 дъмпа файла, т.е.:

mysqldump --skip-opt -u $MY_USER -p$MY_PASS mydb1 > /tmp/dump1.sql

mysqldump --skip-opt -u $MY_USER -p$MY_PASS mydb2 > /tmp/dump2.sql

сравнете, като използвате тези опции за разлика:

diff -y --suppress-common-lines /tmp/dump1 /tmp/dump2