Текущата ви заявка по същество извършва INNER JOIN
поради consultant_id = 5
на WHERE
клауза. Вярвам, че наистина искате да използвате:
SELECT *
FROM consultant_memberships m
LEFT OUTER JOIN consultant_memberships_list l
ON m.`id` = l.membership_id
AND l.consultant_id = 5
WHERE l.membership_id IS NULL;
Вижте SQL Fiddle с демонстрация