Това може да означава, че MYSQL не работи или използвате грешно име на хост, докато се свързвате. Друга възможна причина за това може да бъде разликата в конфигурацията на сокета на php спрямо mysql, можете да го проверите, като погледнете входния сокет в конфигурацията на mysql. файл и като погледнете изхода на phpinfo(), трябва просто да го сравните. Или някой друг на вашата машина също използва този сокет.
PS Освен това моето диво предположение, прегледайте кода си и проверете дали винаги свързвате правилно връзката си, както и всичките си заявки.