Потенциално много опасно, защото можете отново да получите номер, който вече се използва.
Това, което предлагате, е нулиране на последователността отново на 1. Той просто ще произведе 1,2,3,4,5,6,7,.. и така нататък, независимо дали тези числа са в празнина или не.
Актуализация: Според отговора на Мартин, поради свързаните с това опасности, MySQL дори няма да ви позволи да направите това. Ще нулира брояча поне до текущата стойност + 1.
Помислете отново какъв реален проблем причинява наличието на пропуски. Обикновено това е само естетически проблем.
Ако числото стане твърде голямо, превключете към по-голям тип данни (bigint трябва да е много).