Не съм сигурен относно вашето изискване. Това, което разбрах от въпроса ви е, че искате да изтриете всички имейли на работни места, които са затворени. Опитайте този;
DELETE e FROM emailNotification e
LEFT JOIN jobs j ON j.jobId = e.jobId
WHERE j.active = 1 AND CURDATE() < j.closeDate