Изправен съм пред същия проблем като вас, проблемът възниква само когато използвам Opera или Chrome.
За моя случай имам .htaccess да насочи всяко нещо към индексния файл. Естествено браузърът ще поиска скрипта два пъти, веднъж за самия скрипт, а другият е за фавиконата.
Поправката: Опитайте да редактирате .htaccess за да предотвратите пренасочване към индексния файл, когато браузърът изисква favicon.ico
