Вероятно трябва да го промените както за клиента (вие изпълнявате, за да извършите импортирането), така и за демона mysqld, който се изпълнява и приема импортирането.
За клиента можете да го посочите в командния ред:
mysql --max_allowed_packet=100M -u root -p database < dump.sql
Също така, променете файла my.cnf или my.ini (обикновено се намира в /etc/mysql/) под секцията mysqld и задайте:
max_allowed_packet=100M
или можете да изпълните тези команди в MySQL конзола, свързана към същия сървър:
set global net_buffer_length=1000000;
set global max_allowed_packet=1000000000;
(Използвайте много голяма стойност за размера на пакета.)