Грешка:Тази функция не е налична за базата данни, която използвате

хммм, опитайте с

$this->db->query("CALL update_letter_body(".$body_letter.",".$insert_id.")");

call_function позволява ви да извиквате PHP функции на бази данни, които не са включени първоначално в CodeIgniter, а не за извикване на процедури, които сте написали.

проверете документацията

https://www.codeigniter.com/user_guide/database/call_function.html