Проблемът ми всъщност нямаше нищо общо с секвелизирането или настройката на приложението ми. Моят файл package.json използваше app.js вместо bin/wwww за стартиране на npm. По този начин се извикваха app.js и models/index, но не и действителният сървър в bin/www. Всеки, който иска да реши този проблем с незабавен срив в регистрационните файлове на heroku, ето моето предложение. Поставете няколко console.log() във вашия сървър за приложения или файлове на приложения и вижте какво се извиква. Когато обаждането спре, там е проблемът ви.