Публикувах проблема в gitlab, което ми помогна да поправя проблема.https:/ /gitlab.com/gitlab-org/omnibus-gitlab/issues/277
В случай, че някой друг има този проблем или се натъкне на това, публикувам бърз преглед на това как го поправих. В моя случай ми липсваха някои DB отношения. Така че можете да проверите това, като стартиратеsudo gitlab-rake db:migrate:status
Ако някой от тях пише надолу, значи не е приложен.
Можете да опитате да поправите това, като стартиратеsudo gitlab-ctl reconfigure
в моя случай това не реши проблема. Трябваше ръчно да му кажа да изпълнява миграциите на DB със следната командаsudo gitlab-rake db:migrate
След това, когато стартирах sudo gitlab-rake db:migrate:status
всички бяха готови и нямам повече 500 грешки при използване на уебсайта.