Можете да използвате logrotate, за да свършите тази работа вместо вас.
Поставете това в /etc/logrotate.d/mongod (ако приемем, че използвате Linux и сте logrotated инсталиран):
/var/log/mongo/*.log {
daily
rotate 30
compress
dateext
missingok
notifempty
sharedscripts
copytruncate
postrotate
/bin/kill -SIGUSR1 `cat /var/lib/mongo/mongod.lock 2> /dev/null` 2> /dev/null || true
endscript
}