Само едно странно предположение...
... но различните дълги опции трябва да бъдат посочени чрез -- , а не - :
mongoimport --host localhost \
--db roudy123_q \
--collection LebaneseAmericanUniversity\(Lebanon\).json \
--file LebaneseAmericanUniversity\(Lebanon\).json \
--jsonArray
Може би тази конкретна версия на mongoimport е по-прецизен за това и ще третира -db ... -collection ... като позиционни аргументи, а не аргументи на ключови думи?