Мисля, че говорите за драйвер, а не за самия PHP. PHP няма вградена поддръжка за достъп до \Mongo* класове, докато не компилирате и заредите специално разширение.
Тъй като говорите за най-новата версия на MongoDB, мисля, че не можете да използвате някои части от неговата функционалност, защото сте имали някакъв стар драйвер (да речем, 1.2.12). Когато сте надстроили PHP, вероятно сте актуализирали и драйвера до най-новата (1.3.0) стабилна версия. Тази версия на драйвера беше изпратена преди няколко дни и поддържа всички най-нови функции, които MongoDB предоставя.
Както и да е, ако искате да проверите коя версия на драйвера имате, можете да извикате phpinfo(8) от вашия PHP и погледнете резултата за mongo раздел, където се показва версията на драйвера.
