Просто филтрирайте по name свойство, което обозначава името на базата данни. И за да изброите бази данни, започващи с даден префикс, можете да използвате regexp като ^prefix_ :
filter := bson.M{"name": primitive.Regex{Pattern: "^prefix_"}}
Други опции за филтриране са изброени в listDatabases команда
страница:
И можете да използвате празен bson.M{} за вмъкване на празен документ (_id ще бъдат добавени разбира се).