Ще трябва да затворите курсора, тъй като MongoDB сървърът няма да изчака курсора вместо вас, като се има предвид, че изрично сте го помолили да не го прави.
просто извикайте del върху вашия курсор. Реализацията на pymongo по подразбиране за __del__ ще уведоми сървъра да убие курсора.
Ако приемем нещо като:
cursor = db.test.find(timeout=False)
Просто направете това, когато сте готови:
del cursor