намерих отговора
1. първо трябва да получа всички _id
db.items.aggregate( [
{ '$match': { 'owner.id': '9e748c81-0f71-4eda-a710-576314ef3fa' } },
{ '$group': { _id: '$item.id', dbid: { $max: "$_id" } } }
]);
2. тогава трябва да потърся документите
db.items.find({ _id: { '$in': "IDs returned from aggregate" } });
който ще изглежда така:
db.items.find({ _id: { '$in': [ '1', '2', '3' ] } });