Използвайки QueryBuilder, вашата заявка трябва да изглежда така
DBObject query = QueryBuilder.start().or(
QueryBuilder.start("key1").in(764).get(),
QueryBuilder.start("key2").in(keys).get(),
QueryBuilder.start().and("key3").is(3).and("key4").is(64).get()
).get();
Обмислете използването на jongo (API над mongo-java-driver) можете просто да копирате/поставите заявки от обвивката:
collection.findOne("{$or:[{key1: {$in:[764]}},{key2:{$in:[#]}}, {$and:[{key3:3},{key4:67}]}]}", keys).as(People.class);