Понастоящем (MongoDB 3.2) агрегирането не поддържа executionStats, с опцията за обяснение в агрегацията получавате някои данни, свързани със заявката, но в нея няма executionStats. Предлага се и можете да проверите състоянието му тук
https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-19758
Моля, гласувайте за проблема, ако искате да го внедрите скоро.