Във вашия пример вие всъщност използвате DocumentDB с MongoDB съвместимост. Не използвате родния MongoDB (нито пък този собствен MongoDB като услуга).
DocumentDB (дори с MongoDB compat) не предоставя oplog. И тъй като Meteor зависи от четенето на oplog, не бихте могли да насочите Meteor към DocumentDB.
Във вашия случай ще трябва или да стартирате родния MongoDB самостоятелно (напр. във виртуални машини), или да се възползвате от решение за хостинг на MongoDB на трета страна, което предоставя поддръжка на MongoDB в рамките на същия регион като вашето приложение. (добре, да, можете да стартирате приложението си в различен регион, но ще видите забавяне заедно с таксите за изходящи данни).