1. Да, правилно е.
2. Не, по-добре е да дадете на mongodb възможно най-много дисково пространство (ако mongodb може да отдели повече пространство, отколкото по-малко дисково фрагментиране, което ще имате, допълнителното разпределяне на пространство е скъпа операция). Но ако желаете, можете да стартирате db.repairDatabase() от mongodb shell за намаляване на размера на базата данни.
3. Да, можете да стартирате repairDatabase на екземпляр на mongodb на живо (по-добре е да го стартирате без пикови часове)