Проблема решен. Проблемът беше, че имам повече профили в моя файл application.yml и не декларирам името на базата данни в профила heroku, така че четеше името на базата данни от профила по подразбиране. Под файла application.yml
spring:
data:
mongodb:
database: pizza-store
uri: mongodb://localhost:27017
price-point-multiplier : 0.1
---
spring:
profiles: docker
data:
mongodb:
database: pizza-store
uri: mongodb://mongodb:27017
---
spring:
profiles: heroku
data:
mongodb:
uri: ${MONGODB_URI}