Трябва да импортирате кодека DBRef, за да го отпечатате, ако искате да е в json стил на документ, трябва да напишете свой собствен кодек за DBRef и да го добавите към кодовия регистър, който давате на Json().
напр.
CodecRegistry codecRegistry = MongoClientSettings.getDefaultCodecRegistry();
-------
final DocumentCodec codec = new DocumentCodec(codecRegistry, new BsonTypeClassMap());
-------
System.out.println(document.toJson(codec));