Преобразуване на съхранена дата от монго обратно в милисекунди от епохата на Unix при зареждане?

Можете да добавите версията с числови милисекунди на timestamp като виртуален атрибут на схемата:

schema.virtual('timestamp_ms').get(function() {
  return this.timestamp.getTime();
});

След това можете да активирате включването на виртуалното поле в toObject извиква екземпляри на модел чрез опция във вашата схема:

var schema = new Schema({
  timestamp: Date
}, {
  toObject: { getters: true }
});