Можете да добавите заявка към вашата декларация за актуализиране:
db.foo.update({'title.de': {$exists : false}}, {$set: {'title.de': ''}})
Актуализиране
За вашия модифициран въпрос моето решение изглежда така - това ще работи ли за вас? (Ако не, защо?)
db.foo.update({site_id: 'xxx', 'title.de': {$exists : false}}, {$set: {'title.de': ''}, {multi: true})
db.foo.update({site_id: 'xxx', 'content.de': {$exists : false}}, {$set: {'content.de': ''}}, {multi: true})