Как да вмъкна документ в mongodb с помощта на mongoose и да получите генерирания идентификатор?

Можете да генерирате _id себе си и го изпратете в базата данни.

var ObjectID = require('mongodb').ObjectID;

var user = {
  a: 'abc',
  _id: new ObjectID()
};

conn.collection('aaa').insert(user);

Това е една от любимите ми функции на MongoDB. Ако трябва да създадете множество обекти, които са свързани помежду си, не е необходимо да правите многобройни обиколки между приложението и db. Можете да генерирате всички идентификатори в приложението и след това просто да вмъкнете всичко.