Можете да използвате $addToSet с рамката за агрегиране, за да преброите различни обекти.
Например:
db.collectionName.aggregate([{
$group: {_id: null, uniqueValues: {$addToSet: "$fieldName"}}
}])
Или разширено, за да получите вашите уникални стойности в правилен списък, а не в поддокумент в нулев запис _id:
db.collectionName.aggregate([
{ $group: {_id: null, myFieldName: {$addToSet: "$myFieldName"}}},
{ $unwind: "$myFieldName" },
{ $project: { _id: 0 }},
])