Вмъкнете голям запис в mongodb с помощта на mongo shell

cat просто чете файла, не анализира файла като json.

Опитайте:

var file = JSON.parse(cat('/home/vivek/locationCoordinates.json'));
db.geoPolygonData.insert({"polygonName":"location6", "polygons":{"type":"Polygon", coordinates:[file]}});