Актуализация:
Започвайки от v4.4 има специален оператор $first:
{ $project: {
user: { $first: "$users" },
otherField: 1
}},
Това е синтактична захар за
Оригинален отговор:
Можете да използвате arrayElemAt:
{ $project: {
user: { $arrayElemAt: [ "$users", 0 ] },
otherField: 1
}},