Как да премахнете дублиращи се записи от масив?

От MongoDB 2.2 можете да използвате рамката за агрегиране с $unwind , $group и $project етап за постигане на това:

db.users.aggregate([{$unwind: '$favorites.books'},
                    {$group: {_id: '$_id',
                              books: {$addToSet: '$favorites.books'},
                              name: {$first: '$name'}}},
                    {$project: {'favorites.books': '$books', name: '$name'}}
                   ])

Обърнете внимание на необходимостта от $project за да преименувате favorites поле, тъй като $group обобщените полета не могат да бъдат вложени.