Това всъщност не е работа на phpMyAdmin, GUI за начинаещи в MySQL.
Поставете заявката в скрипт, в цикъл, който се изпълнява 1 000 000 пъти.
Въпреки че това не е много добър еталон за нищо. Ако се опитвате да симулирате реално търсене, трябва да имате някои едновременни дейност, а не само 1 000 000 заявки, издадени и върнати една по една.
