Имах подобен проблем и изтеглих буркана от http://mvnrepository.com/artifact/org.freemarker/freemarker, което се справи добре.
Когато погледнете build.gradle в DaoGenerator-проекта ще намерите зависимост, която сочи точно към този артефакт. Предполагам, че използването на gradle за изграждане на вашия проект автоматично изтегля тези зависимости, точно както прави maven. Ако не желаете да използвате нито едно от двете, вероятно е добре да изтеглите и включите артефактите ръчно.
