Това е малко по-сложен проблем, отколкото ми се иска да го обмисля докрай в момента, но ще ви дам една идея за начало и може би някой друг може да ви помогне да я завършите...
Присъединете таблицата към себе си така:
Select A.JobID, A.Sequence, Count(*)
from TheTable A join
TheTable B on A.JobID <> B.JobID and A.Sequence = B.Sequence
group by A.JobID
Не съм го тествал, така че може да има правописни грешки, но се надявам, че схващате идеята. Забележете, че се присъединявате, където работата не е същата, но последователността е.