Има хубава публикация тук който подробно описва един начин за това.
Ще трябва да използвате ConnectionManager и да зададете свойството ConnectionString за това от конфигурационен пакет.
Свойството ConnectionString е напълно квалифициран низ за свързване към база данни, като
Data Source=localhost;Initial Catalog=SSISConfig;Provider=SQLNCLI.1;Integrated Security=SSPI;Auto Translate=False;
Има няколко проблеми и неприятности при използването на конфигурационни пакети, така че може да се наложи да се помотаете малко. Бих бил по-подробен, но мина около година, откакто последно работих по SSIS проект.
Ако имате някакви конкретни проблеми, моля, върнете се и коментирайте какво сте попаднали. Ще се опитам да запаля старите спомени.