Друг вариант е да добавите нещо подобно към VM параметрите на основния клас на проекта:
-Djava.library.path="C:\Program Files\Microsoft JDBC Driver 4.0 for SQL Server\sqljdbc_4.0\enu\auth\x64"
(посочвайки пътя до файла sqljdbc_auth.dll). Няма нужда да променяте PATH на средата или jvm параметрите на Eclipse IDE.
За основния клас на проекта изберете опция от менюто Run As >> Run Configurations... 
