Опитайте това, ако се опитвате да изпълните .sql файл в SSMS:
:r C:\Scripts\Script1.sql
:r C:\Scripts\Script2.sql
:r C:\Scripts\Script3.sql
...
забележка:за да се стартира това, включете командния режим на sql (Запитване> Режим SQLCMD)
Ако това са скриптове, които изпълнявате доста често, може да помислите да ги пуснете в съхранена процедура и да ги стартирате по този начин...
Можете също да го направите чрез sqlcmd (което според мен е по-често):
sqlcmd -S serverName\instanceName -i C:\Scripts\Script1.sql